《潘達利亞之珠》的主要故事發生在大災變之前，聯盟和部落聯軍前往諾森德北伐巫妖王的時候，但諾森德的故事與本作無關。
本作將展現死亡之翼肆虐之前艾澤拉斯的景象。故事的主角是麗麗·風暴烈酒，她讀著叔叔，陳·風暴烈酒的信長大，她厭倦了呆在家裏，決定外出尋找叔叔。她的父親擔心她的安慰，于是派出波(Bo)，壹位訓練年輕熊貓人如何進行戰鬥的堅韌的戰士，去尋找麗麗，並將她安全的帶回家；麗麗則要波幫助她尋找陳，故事將圍繞這兩人展開。
此外還有壹系列反派將在故事中登場，包括壹個娜迦海巫，壹個地精煉金術師(像war3裏那樣騎著食人魔)和壹個邪獸人劍聖。故事的主題是：探索世界，發現世界和其他其他文化的魅力，冒險，面對恐懼和挑戰。
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